Beaupuy est un village encore rurale offrant à ses habitants un cadre de vie par la qualité de son site et de ses paysages. L’habitat est étendu sur un territoire agricole entre le village et ses différents lieux-dits.
Commune française située dans le sud-ouest du département de Tarn et Garonne, en région Occitanie, elle est entouré par les communes de Bouillac, Bellesserre et Comberouger, Beaupuy est situé à 15 km au nord-ouest de Grenade en Haute Garonne la plus grande ville aux alentours , de 35 km de Montauban et 45 km de Toulouse.
Exposée à un climat océanique altéré, elle est drainée par le ruisseau de Dère, le ruisseau de Nadesse et par divers autres petits cours d'eau. La commune possède un patrimoine naturel remarquable composé de trois zones naturelles d'intérêt écologique, faunistique et floristique et fait partie de l’inventaire national de patrimoine naturel défini comme « l'inventaire des richesses écologiques, faunistiques, floristiques, géologiques, minéralogiques et paléontologiques.